• SMALLOMICS- MODERN MICROBIOLOGICAL LABORATORY OF MICROBIOME STUDY

Περιβάλλον

img-03
img-02

Μοριακές Αναλύσεις
Περιβαλλοντική Μελέτη

Το τεράστιο φάσμα εφαρμογών των τεχνικών αλληλούχισης του DNA απαντά σε πάσης φύσεως περιβαλλοντικές μελέτες.

Δημόσιοι και ιδιωτικοί οργανισμοί, που έχουν ως μέλημα την προστασία του περιβάλλοντος, μπορούν να απευθυνθούν στη Smallomics για την ολοκληρωμένη μελέτη των περιβαλλοντικών επιπτώσεων από ανθρώπινες δραστηριότητες και συγκεκριμένα για:

  • Βιομηχανική δραστηριότητα πάσης φύσεως,
  • Ακραία καιρικά φαινόμενα,
  • Έντονη γεωργική δραστηριότητα,
  • Αστικά λύματα και συσσώρευση σκουπιδιών,

Είναι μόνο μερικά παραδείγματα περιπτώσεων που μπορούν να επηρεάσουν σημαντικά και αρνητικά τη λειτουργία ενός οικοσυστήματος, βάζοντας σε κίνδυνο την ποιότητα ζωής των ανθρώπων και άλλων ζωντανών οργανισμών (ζώα, φυτά).

Πως γίνεται;

Η επιστημονική βιολογική κοινότητα έχει σαφώς καταλήξει πως η παρουσία ή απουσία συγκεκριμένων μικροβίων είναι ο σημαντικότερος παράγοντας διατάραξης της εύρυθμης λειτουργίας ενός οικοσυστήματος.

Στην Smallomics μπορούμε να χαρτογραφήσουμε ολοκληρωτικά τη μικροβιακή σύσταση ενός δείγματος.

Με αυτά τα δεδομένα είμαστε σε θέση να καθορίσουμε εκείνους τους μηχανισμούς που οδηγούν σε υποβάθμιση του περιβάλλοντος και να προτείνουμε διορθωτικές παρεμβάσεις.

Α) Περιβαλλοντική παρακολούθηση (Monitoring)

Με ένα ενιαίο και μακροπρόθεσμο πλάνο συστηματικού ελέγχου και αξιολόγησης της ποιότητας του νερού επιτυγχάνεται η μέγιστη ποιότητα.

Αναλύοντας το μικροβίωμα από συγκεκριμένα σημεία δειγματοληψίας σε τακτά χρονικά διαστήματα, είναι δυνατή η έγκαιρη ανίχνευση/πρόβλεψη μεταβολών που μπορεί να επηρεάσουν αρνητικά την ποιότητα ή/και την ασφάλεια.

Αποτελεί μια δυναμική διαδικασία καθώς δημιουργείται βάση δεδομένων, η οποία εμπλουτίζεται σε βάθος χρόνου με νέα στοιχεία. Από τη βιοστατιστική ανάλυση είναι δυνατή η ιχνηλάτηση και η αναγνώριση προέλευσης μιας ανωμαλίας σε μικροβιακή σύνθεση.

Ενδεικτικά, συστηματική παρακολούθηση μπορεί να εφαρμόζεται στα:

1) Ύδατα

  • Πόσιμο νερό
  • Νερό καθαρισμού
  • Λύματα/Βιολογικός καθαρισμός
  • Υδάτινα περιβαλλοντικά οικοσυστήματα (ποτάμια, λίμνες)

2) Έδαφος

  • Καλλιεργητικά εδάφη
  • Χωματερές

3) Φυτική Βλάστηση

Β) Αλυσιδωτή αντίδραση Πολυμεράσης (realtime – P.C.R.)

Το τελευταίο χρονικό διάστημα, γνωρίσαμε όλοι τη συγκεκριμένη μοριακή τεχνική. Ήδη εφαρμόζεται σε μια μια ευρεία γκάμα αναλύσεων που βασίζεται στον ποιοτικό και ποσοτικό προσδιορισμό γονιδίων.

Η P.C.R. πλεονεκτεί προτάσσοντας ταχύτητα, αξιοπιστία και ανταγωνιστικά κόστη.

Ενδεικτικά παρατίθενται ορισμένες δυνατότητες P.C.R. αναλύσεων που εφαρμόζει η Smallomics:

  • Ποιοτικός και Ποσοτικός προσδιορισμός παθογόνων και αλλεργιογόνων μικροοργανισμών (E. Coli, Shigella, Salmonella, Fungi, Campylobacter κ.α.)
  • Ανίχνευση γενετικά τροποποιημένων οργανισμών (GMOs)
  • Εντοπισμός Γονιδίων Ανθεκτικών στα Αντιβιοτικά (ARGs)