• SMALLOMICS- MODERN MICROBIOLOGICAL LABORATORY OF MICROBIOME STUDY

Spatially uniform but temporally variable bacterioplankton on a semi-enclosed coastal area

Systematic and Applied Microbiology

Alexandra Meziti, Konstantinos A. Kormas, Maria Moustaka-Gouni, Hera Karayanni

 

Οι μελέτες που εστιάζουν στη χρονική και χωρική κατανομή του βακτηριοπλαγκτού σε παράκτιες περιοχές που επηρεάζονται από ανθρώπινες δραστηριότητες, είναι περιορισμένες. Επιπρόσθετα η μελέτη τους είναι πιο σύνθετη από αυτή των αντίστοιχων κοινοτήτων στην ανοιχτή θάλασσα. Σε αυτή τη μελέτη, εξετάσαμε πέντε διαφορετικά σημεία στον Κόλπο της Ηγουμενίτσας, σε μία περίοδο εννέα μηνών, με την χρήση 16S rDNA 454-pyrosequencing, με στόχο να εξετάσουμε τις επιδράσεις των χωρικών και των χρονικών αλλαγών στις βακτηριακές κοινότητες του Κόλπου. Οι χρονικές διαφορές ήταν πιο έντονες από τις χωρικές, με χαμηλότερους δείκτες ποικιλότητας να παρατηρούνται κατά τους καλοκαιρινούς μήνες. Κατά τη διάρκεια του χειμώνα και στην αρχή της άνοιξης, στις βακτηριακές κοινότητες επικράτησαν αντιπρόσωποι της ομάδας SAR11, ενώ αυτό το πρότυπο άλλαξε το Μάιο, όταν αυτά τα βακτήρια αντικαταστάθηκαν απότομα από αντιπροσώπους των Flavobacteriales, Pseudomonadalesκαι Alteromonadales.

Η ανάλυση συσχετίσεων έδειξε αρνητικές συσχέτισεις μεταξύ της παρουσίας των SAR11 και της θερμοκρασίας και της ηλιοφάνειας, οι οποίες πιθανώς οδήγησαν άμεσα ή έμμεσα στην εξαφάνιση αυτών των OTUs κατά τους καλοκαιρινούς μήνες. Η επικράτηση των SAR11 κατά τους χειμερινούς μήνες, ενίσχυσε περαιτέρω την παγκόσμια κατανομή του κλάδου όχι μόνο στην ανοιχτή θάλασσα αλλά και σε παράκτια συστήματα. Αυτή η μελέτη έδειξε ότι συγκεκριμένα βακτήρια επιδεικνύουν ξεκάθαρα πρότυπα διαδοχής σε ένα παράκτιο σύστημα με ανθρωπογενείς επιδράσεις. Το μεγαλύτερο μέρος του βακτηριοπλαγκτού αντιπροσωπεύθηκε από κοινά θαλάσσια βακτήρια, ενώ χερσαίοι και κοινοί στο γλυκό νερό φυλότυποι απουσίαζαν.

Διαβάστε περισσότερα εδώ: https://doi.org/10.1016/j.syapm.2015.04.003