Environmental Microbiology
A. Meziti, E. Nikouli, J. K. Hatt, K. T. Konstantinidis, K. A. Kormas
Οι γεωθερμικές πηγές επηρεάζονται ελάχιστα από εξωτερικές περιβαλλοντικές συνθήκες αφού τροφοδοτούνται συνεχώς από υποεπιφανειακό νερό με μικρές διαφοροποιήσεις στα γεωχημικά χαρακτηριστικά. Επομένως αναμένεται οι αλλαγές στη σύσταση και τη λειτουργία των μικροβιακών κοινοτήτων, να είναι περιορισμένες. Αυτή όμως η υποθέση δεν έχει διερευνηθεί ενδελεχώς ακόμα. Για αυτόν το λόγο πραγματοποιήσαμε αλληλούχηση ολικού μεταγονιδιώματος σε 17 δείγματα νερού που συλλέχθηκαν, από το 2010 μέχρι το 2016 (δύο εώς τέσσερα δείγματα τον χρόνο), από τις θειούχες γεωθερμικές πηγές των Θερμοπυλών στην κεντρική Ελλάδα. Όπως αποκάλυψαν τα κομμάτια 16SrRNA γονιδίων που εξήχθησαν από τα μεταγονιδιώματα, οι λειτουργικές ταξινομικές μονάδες (OperationalTaxonomicUnits, OTUs), που ανήκουν στα Epsilonproteobacteria, επικράτησαν στα περισσότερα δείγματα, ενώ η ομαδοποίηση των δειγμάτων δεν αποκάλυψε κανένα εποχικό πρότυπο.
Οι ομοιότητες ανάμεσα στα δείγματα βάσει της αφθονίας των λειτουργικών γονιδίων ήταν υψηλές, ειδικά συγκριτικά με άλλα επιφανειακά οικοσυστήματα στον ελλαδικό χώρο, με όλα τα δείγματα να παρουσιάζουν ομοιότητες >70% με βάση τα λειτουργικά μονοπάτια. Τα πρότυπα αυτά εξακριβώθηκαν και μετά την ανάλυση των γονιδιώματων που προέκυψαν από τα μεταγονιδιώματα (MetagenomeAssembledGenomes, MAGs), που έδειξε επιπρόσθετα ότι καινούρια είδη και γένη της Τάξης Campylobacteralesεπικρατούν στις πηγές. Αυτά τα MAGs παρουσίασαν διαφορετικά μονοπάτια οξείδωσης των θειοθειικών και των σουλφιδίων παράλληλα με μονοπάτια δέσμευσης διοξειδίου του άνθρακα. Συνολικά, η μελέτη μας έδειξε ότι ακόμα και σε βάθος χρόνου, οι λειτουργίες των μικροβιακών κοινοτήτων σε μεσόθερμες χερσαίες πηγές παραμένουν σταθερές, βοηθώντας και την αντίστοιχη σταθερότητα στη δομή των βακτηριακών κοινοτήτων.
Διαβάστε περισσότερα εδώ: https://doi.org/10.1111/1462-2920.15373
